Kartanolla on 1,2 ha kokoinen vanha omena-, kirsikka- ja päärynätarha. Kuusiston kartanossa oli ainutlaatuinen hedelmätarha jo 1800-luvun loppupuoliskolla. Vanhimmat omenapuista lienevät siis noin 100–150vuotiaita. Hedelmätarhassa on nykyisin yli 50 omenapuuta, joitakin päärynäpuita, melkoinen kirsikkapuumetsikkö sekä nuorempia luumupuita. Kartanoa ympäröi myös istutettujen jalopuiden joukko, jossa tammet, jalavat, saarnet ja lehmukset tuovat varjoa kuumana kesäpäivänä. Kartanon puutarha mainitaan lähteissä 1779 ja kartanon puiston vanhimmat osat ovat peräisin 1780-luvulta. Puusto on pääosin 1800-luvun alusta, mm. kartanolta Kuusiston linnalle päin johtava puistolehmuskuja.